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Buchhaltungssoftware fuer Online-Haendler: 5 Loesungen im Vergleich

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Das Wichtigste in Kürze

  • Online-Haendler brauchen Buchhaltung mit Shop- und Marktplatz-Integration (Amazon, Shopify, eBay)
  • sevDesk ab 8,90 EUR/Monat hat die meisten nativen E-Commerce-Schnittstellen (9 Plattformen)
  • Bei EU-Verkaeufen ueber 10.000 EUR/Jahr: OSS-Verfahren fuer zentrale Umsatzsteuermeldung nutzen
  • Ab 2025 E-Rechnungen empfangen Pflicht, ab 2027/2028 auch versenden

Wer ueber Amazon, Shopify oder eBay verkauft, kennt das Problem: Hunderte Transaktionen pro Monat, verschiedene Gebuehrenstrukturen, Retouren, und ab einer bestimmten Umsatzschwelle auch noch Umsatzsteuer in anderen EU-Laendern. Manuell laesst sich das nicht sauber abbilden.

Buchhaltungssoftware fuer Online-Haendler muss sich direkt mit Ihren Verkaufsplattformen verbinden. In diesem Vergleich zeigen wir fuenf Programme, die das koennen, was sie kosten und wo die Unterschiede liegen.

80,6 Mrd. EUR

E-Commerce Umsatz DE 2024 (bevh)

55 %

Marktplatz-Anteil am E-Commerce

10.000 EUR

OSS-Schwelle fuer EU-Verkaeufe

Fuenf Buchhaltungsprogramme im Vergleich

Die folgende Tabelle zeigt, welche Grundfunktionen die fuenf Programme mitbringen. Weiter unten gehen wir auf die E-Commerce-spezifischen Integrationen und Preise ein.

FunktionsevDeskLexware OfficeBuchhaltungsButlerFastBillPapierkram
Preis ab8,90 EUR/M.7,90 EUR/M.24,95 EUR/M.9,00 EUR/M.0 EUR/M.
ZielgruppeMulti-ChannelEinsteigerVielbucherRechnungsfokusSparfuechse
GoBD-konform
DATEV-Export
Bankanbindung
Rechnungen
Ausgaben
Auswertungen
Mehrbenutzer
Mobile App
API-Zugang
Bewertung
4.5
4.3
4.4
4.1
4.2
DetailsDetailsDetailsDetailsDetails

Preise netto, Stand Maerz 2026. Die Preise zeigen den guenstigsten verfuegbaren Tarif des jeweiligen Anbieters, nicht zwingend den E-Commerce-tauglichen Tarif. Details in der Preistabelle weiter unten.

Welche Integrationen bringt welches Programm mit?

Die Anbindung an Shopsysteme und Marktplaetze ist fuer Online-Haendler das Auswahlkriterium schlechthin. Hier unterscheiden sich die Programme deutlich.

PlattformsevDeskLexware OfficeBuchhaltungsButlerFastBill
AmazonNativsync4BillbeeBillbee
eBayNativsync4BillbeeBillbee
ShopifyNativApp (10 USD/M.)NativBillbee
WooCommerceFaktur Prosync4/ZapierBillbeeBillbee
ShopwareNativsync4Billbee--
EtsyNativ--BillbeeBillbee
Kaufland----Billbee--

Nativ = direkte Integration vom Anbieter. Billbee/sync4/Faktur Pro = Middleware noetig. Stand Maerz 2026.

sevDesk hat die breiteste Abdeckung mit neun nativen Integrationen (Amazon, eBay, Shopify, Shopware, ePages, xtCommerce, Magento, Etsy und Billbee als Middleware). Wer auf mehreren Plattformen gleichzeitig verkauft, hat hier am wenigsten Einrichtungsaufwand.

Lexware Office setzt staerker auf Partner-Apps. Fuer Shopify gibt es eine eigene App im Shopify App Store (10 USD/Monat). Andere Plattformen laufen ueber sync4 oder Zapier, was zusaetzliche Kosten verursacht.

BuchhaltungsButler punktet bei der Automatisierung: Das Transaction-ID-Matching gleicht Rechnungen automatisch mit Zahlungseingaengen ab. Wer viele hundert Transaktionen pro Monat verarbeitet, spart damit spuerbar Zeit.

Preise im Detail

Die Einstiegspreise aus der Vergleichstabelle oben taugen nur bedingt zur Orientierung. Fuer eine funktionierende E-Commerce-Buchhaltung brauchen Sie meistens einen hoeherwertigen Tarif. In der folgenden Tabelle sehen Sie, welcher Tarif welche Funktionen mitbringt.

Anbieter / TarifPreis/MonatEUeRShop-IntegrationLaufzeit
sevDesk Rechnung8,90 EURNeinJa24 Mon.
sevDesk Buchhaltung19,90 EURJaJa24 Mon.
sevDesk Warenwirtschaft39,50 EURJaJa + WaWi24 Mon.
Lexware Office S7,90 EURNeinueber Partnermonatl.
Lexware Office M12,90 EURNeinueber Partnermonatl.
Lexware Office L21,90 EURJaueber Partnermonatl.
BuchhaltungsButler Vorbucher24,95 EURNeinBillbeemonatl.
BuchhaltungsButler Selbstbucher29,95 EURJaBillbeemonatl.
BuchhaltungsButler E-Commerce Smart54,90 EURJa1 Schnittstelle inkl.jaehrl.
FastBill Plus9,00 EURNeinBillbeemonatl.
Papierkram S9,90 EURJaNeinmonatl.

Gruen hinterlegt = EUeR-faehiger Tarif. Alle Preise netto, Stand Maerz 2026. Quellen: trusted.de, taxandbytes.de, Anbieter-Webseiten.

Auffaellig: Papierkram hat zwar den guenstigsten EUeR-Tarif (9,90 EUR/Monat), bietet aber keine E-Commerce-Schnittstellen. Fuer reine Offline-Freiberufler ist das attraktiv, fuer Online-Haendler aber unbrauchbar. Mehr dazu unter Buchhaltungssoftware fuer Freiberufler.

Warenwirtschaft, Buchhaltung, ERP: Was brauchen Sie wirklich?

Online-Haendler verwechseln diese drei Begriffe oft. Die Unterschiede sind allerdings relevant fuer die Softwareauswahl:

MerkmalKategorieWas sie tutBeispieleWann noetig
BuchhaltungssoftwareBuchhaltungssoftwareRechnungen, Belege, EUeR, DATEV-Export, Steuerberater-AnbindungsevDesk, Lexware Office, BuchhaltungsButlerAb dem ersten Verkauf
WarenwirtschaftWarenwirtschaft (WaWi)Bestellungen, Lagerbestand, Versand, Retouren, Multi-Channel-AbgleichBillbee, JTL, plentymarketsAb ca. 50-100 Bestellungen/Monat
ERP-SystemERP-SystemWaWi + Buchhaltung + CRM + Einkauf + Produktion in einemreybex, Xentral, SAP Business OneAb ca. 10-20 Mitarbeitern

In der Praxis kombinieren viele Haendler zwei separate Programme: Eine Warenwirtschaft wie Billbee fuer Bestellabwicklung und Versand, und eine Buchhaltungssoftware fuer die Finanzbuchhaltung. Billbee leitet die Rechnungsdaten dann automatisch an sevDesk, FastBill oder BuchhaltungsButler weiter.

Wer alles in einem Programm moechte, kann sevDesk Warenwirtschaft nutzen (39,50 EUR/Monat). Das Programm deckt dann Rechnungen, Buchhaltung und Warenwirtschaft ab, hat aber bei Lagerbestandsfuehrung und Versandsteuerung Grenzen gegenueber spezialisierten WaWi-Systemen.

Amazon FBA: Was bei der Buchhaltung anders ist

Amazon FBA (Fulfillment by Amazon) bedeutet, dass Amazon Ihre Waren lagert, verpackt und versendet. Das klingt bequem, macht die Buchhaltung aber komplizierter, weil Amazon verschiedene Gebuehren verrechnet:

  • Verkaufsprovision (Referral Fee), je nach Kategorie 7-15 % des Verkaufspreises
  • Versand- und Verpackungsgebuehren (FBA Fee), abhaengig von Groesse und Gewicht
  • Lagergebuehren (Storage Fee), monatsweise nach Kubikmeter
  • Langzeitlagergebuehren fuer Ware, die laenger als 365 Tage im Lager liegt

All diese Posten stehen in den sogenannten Settlement Reports, die Amazon alle 14 Tage erstellt. Spezialisierte Tools wie AMAINVOICE (ab 43 EUR/Monat fuer bis zu 200 Belege) importieren diese Reports und erzeugen daraus saubere Buchungssaetze, die Sie per DATEV-Export an Ihren Steuerberater weitergeben koennen.

Wer nur vereinzelt ueber Amazon verkauft (weniger als 50 Bestellungen/Monat), kann die Settlement Reports auch manuell in sevDesk oder Lexware Office importieren. Die native Amazon-Integration von sevDesk erledigt das automatisch.

Das OSS-Verfahren: EU-Umsatzsteuer fuer Online-Haendler

Wer an Privatkunden in anderen EU-Laendern verkauft, muss ab einer bestimmten Umsatzschwelle die Umsatzsteuer im jeweiligen Empfaengerland abfuehren. Seit Juli 2021 gibt es dafuer das OSS-Verfahren (One-Stop-Shop), das die Meldung vereinfacht.

MerkmalRegelungDetails
SchwelleSchwelle10.000 EUR/Jahr, EU-weit zusammengerechnet (nicht pro Land)
Unter der SchwelleUnter der SchwelleDeutsche USt. auf alle EU-Verkaeufe an Privatkunden
Ueber der SchwelleUeber der SchwelleUSt. des Empfaengerlandes, Meldung ueber OSS moeglich
MeldefristMeldefristQuartalsweise bis zum letzten Tag des Folgemonats
TeilnahmeTeilnahmeFreiwillig, aber empfohlen (Alternative: Registrierung in jedem einzelnen EU-Land)
SoftwareSoftwaresevDesk und BuchhaltungsButler unterstuetzen OSS-Berichte

Die 10.000 EUR-Schwelle ist schnell ueberschritten. Wer auch nur einige hundert Euro pro Monat nach Oesterreich, Frankreich oder in die Niederlande verkauft, liegt nach wenigen Monaten darueber. Die IHK Muenchen empfiehlt, sich fruehzeitig fuer das OSS-Verfahren zu registrieren, auch wenn die Schwelle noch nicht erreicht ist, denn die Registrierung ist kostenlos.

E-Rechnungspflicht: Was sich fuer Online-Haendler aendert

MerkmalZeitraumRegelungBetrifft
Ab 01.01.2025Ab 01.01.2025Empfang von E-Rechnungen PflichtAlle Unternehmen
2025-20262025-2026Versand: Uebergangsphase, Papier noch erlaubtAlle Unternehmen
Ab 01.01.2027Ab 01.01.2027Versand Pflicht fuer Unternehmen ueber 800.000 EUR UmsatzGroessere Haendler
Ab 01.01.2028Ab 01.01.2028Versand Pflicht fuer alle UnternehmenAlle Unternehmen

Formate wie ZUGFeRD und XRechnung werden dabei zum Standard. Alle fuenf in diesem Vergleich aufgefuehrten Programme koennen E-Rechnungen empfangen und erstellen. Wer ueberwiegend B2C verkauft (also an Privatkunden), ist beim Versand weniger betroffen. Aber sobald Sie an gewerbliche Kunden (B2B) verkaufen, muessen Sie ab 2027 oder 2028 E-Rechnungen versenden.

Mehr zur GoBD-konformen Buchhaltung und den rechtlichen Anforderungen.

Empfehlung nach Situation

Ihre SituationEmpfohlene SoftwareAb Preis
Einzelner Shopify-Shop, wenig BestellungenLexware Office L + Shopify-App21,90 + 10 USD/M.
Amazon + eBay Multi-ChannelsevDesk Buchhaltung19,90 EUR/M.
Hohes Volumen, 500+ Bestellungen/MonatBuchhaltungsButler E-Commerce Smart54,90 EUR/M.
Amazon FBA mit EU-Versand (PAN-EU)AMAINVOICE + sevDesk/Lexware43 + 19,90 EUR/M.
Wachsender Haendler, bald ERP noetigsevDesk Warenwirtschaft (spaeter: reybex/Xentral)39,50 EUR/M.

Steuerberater-Zusammenarbeit

Gerade bei E-Commerce mit EU-Verkaeufen und Amazon-Gebuehrenstrukturen ist ein Steuerberater mit E-Commerce-Erfahrung sinnvoll. Die DATEV-Schnittstelle ist dabei das Bindeglied: Alle fuenf Programme in diesem Vergleich bieten DATEV-Export.

sevDesk und BuchhaltungsButler gehen einen Schritt weiter und bieten einen Steuerberater-Zugang, ueber den Ihr Berater direkt in der Software arbeiten kann, ohne dass Sie Daten manuell exportieren muessen. Das spart bei der monatlichen Buchhaltung einige Stunden Abstimmungsaufwand.

Eine Uebersicht zu Buchhaltungssoftware-Kosten finden Sie in unserem Kostenvergleich.

Datensicherheit im E-Commerce

Online-Haendler verarbeiten Zahlungsdaten, Kundenadressen und Bestellhistorien. Ein Datenleck kann neben dem Imageschaden auch zu DSGVO-Bussgeldern fuehren. Alle Cloud-Buchhaltungsprogramme in diesem Vergleich hosten ihre Daten in deutschen Rechenzentren und verschluesseln die Uebertragung. Einen vollstaendigen Schutz bieten sie aber nicht.

Wer Kundendaten im groesseren Umfang verarbeitet, sollte ueber eine Cyberversicherung fuer KMU nachdenken. Sie uebernimmt Kosten fuer IT-Forensik, Benachrichtigung betroffener Kunden und Betriebsunterbrechung nach einem Cyberangriff.

Auch eine Berufshaftpflichtversicherung kann relevant sein, etwa wenn Sie als E-Commerce-Berater fuer andere Haendler taetig sind oder wenn durch fehlerhafte Produktdaten Schaeden bei Kunden entstehen.

Fuer wen eignet sich E-Commerce-Buchhaltungssoftware?

Für wen ist E-Commerce Buchhaltungssoftware geeignet?

Geeignet für

  • Online-Shop-Betreiber (Shopify, WooCommerce, Shopware)
  • Amazon FBA und FBM Verkaeufer
  • eBay, Etsy und Kaufland Haendler
  • Multi-Channel-Verkaeufer mit mehreren Plattformen
  • Dropshipping-Unternehmen

Weniger geeignet für

  • Reine Offline-Haendler ohne E-Commerce-Anteil
  • Privatverkaeufer ohne Gewerbeanmeldung
  • Unternehmen mit mehr als 50 Mitarbeitern (besser: ERP-Systeme wie reybex oder Xentral)

Wenn keines der fuenf Programme zu Ihrem Setup passt, lohnt ein Blick auf die Buchhaltungssoftware-Uebersicht oder den Vergleich fuer KMU.

Fuer die meisten Online-Haendler eignen sich sevDesk (ab 8,90 EUR/Monat, starke Shop-Integrationen), Lexware Office (ab 7,90 EUR/Monat, Shopify-App) und BuchhaltungsButler (ab 24,95 EUR/Monat, hohe Automatisierung). Entscheidend sind direkte Schnittstellen zu Ihrem Shopsystem und Marktplaetzen. (Preise: Stand Maerz 2026)

Das haengt vom Volumen ab. Wer unter 50 Bestellungen pro Monat verarbeitet, kommt mit reiner Buchhaltungssoftware aus. Ab 50-100 Bestellungen lohnt sich eine Warenwirtschaft wie Billbee als Zwischenschicht, die Bestellungen von allen Kanaelen buendelt und an die Buchhaltung weitergibt.

Das OSS-Verfahren (One-Stop-Shop) ermoeglicht, die Umsatzsteuer fuer EU-Verkaeufe an Privatkunden zentral in Deutschland zu melden. Es wird noetig, sobald Ihre EU-weiten Fernverkaeufe 10.000 EUR pro Jahr uebersteigen. Die Teilnahme ist freiwillig, vereinfacht aber die Steuermeldung gegenueber Einzelregistrierungen in jedem EU-Land. (Quelle: IHK Muenchen)

Reine Rechnungsprogramme gibt es ab 8,90 EUR/Monat (sevDesk Rechnung). Fuer eine vollstaendige Buchhaltung mit EUeR zahlen Sie 9,90 bis 29,95 EUR/Monat. Spezialisierte E-Commerce-Pakete wie BuchhaltungsButler E-Commerce Smart kosten 54,90 EUR/Monat. Alle Preise netto, Stand Maerz 2026.

Ja. Seit dem 1. Januar 2025 muessen alle Unternehmen in Deutschland E-Rechnungen im Format ZUGFeRD oder XRechnung empfangen koennen. Das betrifft auch Online-Haendler. Die Versandpflicht kommt ab 2027 fuer Unternehmen mit ueber 800.000 EUR Umsatz und ab 2028 fuer alle. (Quelle: BMF)

Amazon FBA erzeugt verschiedene Gebuehrentypen: Verkaufsprovisionen (Referral Fee), Lager- und Versandgebuehren (FBA Fee) und Lagerkosten (Storage Fee). Diese Posten muessen einzeln verbucht werden. Spezialisierte Tools wie AMAINVOICE (ab 43 EUR/Monat) importieren die Settlement Reports und erstellen daraus korrekte Buchungen.

Ja. sevDesk hat native Integrationen fuer Amazon, eBay, Shopify, WooCommerce (ueber Faktur Pro), Shopware, ePages, xtCommerce und Magento. Auch Billbee laesst sich als Middleware anbinden. (Quelle: sevdesk.de)

Ja. Die Kosten fuer Buchhaltungssoftware sind Betriebsausgaben und mindern Ihren Gewinn. Das gilt fuer monatliche Abogebuehren, Einrichtungskosten und auch fuer Zusatz-Apps wie Shopify-Konnektoren.

Fazit

Onlinehaendler brauchen eine Buchhaltungssoftware, die mit Shopanbindung, automatischer Umsatzsteuerberechnung und Versanddienstleister-Integration umgehen kann. Standard-Loesungen fuer Freiberufler reichen hier nicht aus.

Vergleichen Sie die E-Commerce-Funktionen der Anbieter in unserer Uebersicht und achten Sie auf Schnittstellen zu Ihrem Shopsystem (Shopify, WooCommerce, Amazon).